Os laboratórios didáticos do Instituto de Biologia estão localizados nos seus Departamentos e Órgãos Complementares no Campus Universitário do Capão do Leão e nas dependências do Departamento de Morfologia (Campus da Faculdade de Medicina – Avenida Duque de Caxias, 250 – Fragata, Pelotas). Esses laboratórios estão registrados no Núcleo Geral de Laboratórios da UFPEL (NULAB), sendo que, seus regimentos estão em fase de conclusão.
Os laboratórios do Instituto de Biologia listados no NULAB estão organizados da seguinte maneira:
Departamento de Botânica (Em construção)
Departamento de Ecologia, Zoologia e Genética
Departamento de Fisiologia e Farmacologia