El Programa de Posgrado en Ciencia Política de la Universidad Federal de Pelotas tiene sus bases, primeramente, en la significativa presencia del área de Ciencia Política en los cursos que constituyen el Instituto de Filosofía, Sociología y Política. En 1985, se creó el Curso de Especialización en Ciencia Política, en el que – a lo largo de sus 25 años de existencia – obtuvieron su título cerca de 200 alumnos. Este fue el embrión del Curso de Grado en Ciencias Sociales (con opción en el área de investigación), creado en 1991, al que se añadió un nuevo Curso (con opción en el área de enseñanza), en 1994. En 2006, ese esfuerzo conjunto llevó a la implantación del Curso de Maestría en Ciencias Sociales, vinculado al Comité de Sociología de CAPES (Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior), contemplando entre cuatro líneas de investigación, una específica para el Área de Ciencia Política, denominada «Ciudad, Estado y Esfera Pública».
El programa de Posgrado en Ciencia Política (PPGCPol) de la Universidad Federal de Pelotas obtuvo recomendación para el inicio de actividades, por CAPES, en 2010. Estas iniciaron en marzo de 2011, con la primera clase de Maestría formada por trece alumnos. En 2015, el PPGCPol obtuvo la recomendación de CAPES para el funcionamiento del curso de Doctorado, cuya primera clase inició sus actividades con cinco alumnos, en 2016. El PPGCPol es resultado del esfuerzo de fortalecimiento del Área de Ciencia Política y Relaciones Internacionales, en el ámbito de la Universidad y de la región sur de Rio Grande do Sul. El PPGCPol creó parámetros exigentes de selección de candidatos y de asignación de becas de investigación a sus alumnos, teniendo siempre como perspectiva los méritos y la real dedicación de los mismos a las actividades de los cursos. Tal política ha privilegiado, en este sentido, la sólida formación de recursos humanos con vocación académica.El PPGCPol posee un Área de Concentración, «Democracia y Política Contemporánea» y tres líneas de investigación: «Instituciones y Procesos Políticos», «Dinámicas Políticas y Conflictos Sociales» y «Teoría Política y Teoría Social Contemporánea».