O laboratório de Microbiologia foi reestruturado nos últimos anos com recursos de projetos de pesquisa. Ganhou também nova sede com a reforma do prédio da Faculdade. Dentre os equipamentos disponíveis, podem ser ressaltados: agitadores magnéticos, agitadores tipo vortex, autoclaves, balança analítica de precisão, banho-maria, capela de fluxo laminar, centrífuga refrigerada, desruptor de células, destilador e deionizador de água, espetrofotômetro, forno de micro-ondas, freezer, homogeneizador de amostras, incubadoras, jarras de anerobiose, lupas estereoscópicas, microscópio de luz, pHmetro, pipetas automáticas, sonicador e identificador de microrganismos, adquirido em conjunto com outros PPGs via edital CT-INFRA/Finep.

Adicionalmente, encontra-se em funcionamento um sistema complexo para crescimento de biofilmes e simulações intrabucais do tipo “boca artificial”, totalmente planejado e desenvolvido no PPGO, com patente conjunta registrada com uma empresa de equipamentos de abrangência nacional.