A UFPel atualmente está alocada no município de Pelotas e no de Capão do Leão.

No Capão do Leão está localizado o Campus Capão do Leão que reúne várias unidades acadêmicas.

Na cidade de Pelotas, a UFPel está inserida na malha urbana, e o Campus Pelotas conta com prédios espalhados em vários bairros.

Para a organização do Inventário de Espaços UFPel os prédios próprios da instituição, no campus Pelotas, foram agrupados por proximidade geográfica, resultando em 5 zonas: Anglo, Porto, Centro, Norte e Fragata. É a partir desse zoneamento que os prédios são numerados no inventário, considerando a zona e o prédio no código final.

Durante o Ciclo 2 do Processo de Planejamento Integrado Territórios, cada zona receberá um Evento Setorial aberto a toda a comunidade universitária – estudantes, professores, técnicos e funcionários terceirizados -, onde através de algumas metodologias, será realizada a Leitura Comunitária dos cenários atual e desejado para a zona.