O curso de graduação em Biotecnologia, juntamente com o Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia da UFPel, conta com laboratórios de pesquisa e ensino.

Além dos laboratórios, fazem parte da estrutura de ensino, pesquisa e extensão: sala de autoclavagem e esterilização de materiais, sala de equipamentos, sala com câmara fria, sala de reuniões, sala do PPGB, secretaria e coordenação de curso, cozinha e banheiros feminino e masculino.