Um dos maiores objetivos do Programa de Pós-Graduação em Microbiologia e Parasitologia é o reconhecimento e fortalecimento dos nossos grupos de pesquisa é outro objetivo do programa, para isto, convênios de cooperação foram firmados com diversas instituições de ensino e pesquisa do Brasil (EMBRAPA, FIOCRUZ, FURG, RFPR, UFBA, UFGRS, UFMS, UFMT, UFPB, UFSM, UNISINOS, USP, UDESC, UNIPAMPA, UFN, IPVDF, IFFARR, UCS, UFT) e algumas também do exterior (Universidade do Montevidéu — Uruguai, Universidade de Alcalá de Henares — Espanha, Universidade de Surray — Grã-Bretanha, Universidade de Wisconsin — EUA, Universidade de Pullman — EUA), Universidade de Turim (Faculdade de Veterinária) – Itália, Universidade do Porto (UPorto- Faculdade de Ciências) e Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge – Portugal , Universidade de La Plata – Argentina). Os docentes permanentes e colaboradores são estimulados a oferecerem e desenvolverem disciplinas com bases conceituais atuais, com intensa pesquisa bibliográfica, inovação e cunho prático das disciplinas. Da mesma forma que, juntamente com o corpo dicente, fortalecer espaços de construção de laços internacionais, seja via programas de cooperação internacional e Doutorados Sandu´´iche.